Il Progetto Jauaperi nasce nel 1993 dalla collaborazione tra l’Associazione Amazonia e l’Università di Amazonas, con l’intento di estendere agli abitanti di tutto il fiume i benefici derivanti dal lavoro svolto nella Riserva Xixuau. Il bacino del Rio Jauaperi ospita 5 comunità Caboclos e alcuni insediamenti isolati per un totale di 600 persone circa, il 70% delle quali al di sotto dei 15 anni di età. Il progetto ha lo scopo di realizzare diversi obiettivi, come la preservazione e l'uso sostenibile della biodiversità dell’area, l'aumento del grado di autosufficienza delle comunità attraverso lo sviluppo sostenibile, l'analisi dei problemi sanitari e legati all’istruzione al fine di fornire i servizi necessari, l'applicazione di tecniche eco-compatibili di sfruttamento delle risorse forestali e lo sviluppo di progetti di ricerca scientifica in collaborazione con università, istituti e enti, finalizzati allo studio di nuovi modelli ambientali basati sulla realtà locale.